东京、大阪、京都相继发生杀人事件，5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害。警方介入调查，发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员。该集团共有成员8名，以义经的家臣名字互相称呼，且都持有一本《义经记》，被害5人手中的《义经记》均被拿走。
　　这日京都古寺山能寺收到奇怪书信，说若能解开信中所附的画谜，便能找到8年前被窃的如来佛像。柯南、小兰随毛利小五郎来到该寺，均对画谜一筹莫展。5名被杀者之一曾对与新一不相上下的大阪高中生服部平次照料有加，服部也来到京都对案件秘密展开调查，并借机找寻自己的初恋情人。柯南与服部相遇联手调查时，发现有人想置服部于死地，紧接“源氏萤”另一成员被害，而这一切，似乎又都与画谜有关。

当地球成为密室，你有办法密室逃脱吗？在宇宙高度文明、星际间可以自由通航的未来世界，一场陨石雨毁掉了大半个地球。高等势力银河眼借保护地球之名，展开了“天墙计划”。岂料，天墙一旦升起，便再也无法打开。而这却仅仅是冰山一角，更大的灾难还在酝酿。少年麦当坚信，即便再可怕的困境，只有冲出去，才有希望！

16 歲的男孩小樹，蹺家、逃學、在街頭被霸凌，因為無法面對自己的困境，認為自己是個垃圾，於是逃到廢棄城，歡喜地讓自己變成垃圾，安逸地躲在廢棄城。小樹唯一的朋友阿袋，是個 30 歲的破爛塑膠袋，卻從來不承認自己是垃圾，認為自己是個男孩，想盡辦法要逃出廢棄城，立志率領眾廢棄物逃離，尋找族人傳說的回收場，開始自己想像的人生。
要逃出去，阿袋必須對抗鐵甲垃圾車，所以阿袋需要小樹的幫助，然而留戀廢棄城的小樹，想把朋友留在身邊、留在廢棄城，於是表面上答應幫阿袋，私下卻通風報信，企圖暗地破壞阿袋的逃離計畫，不料，小樹的背叛，導致阿袋逃亡時被捕，面臨唯一死刑要送進焚化爐，朋友不但留不住反而要永久分離，小樹驚覺闖了大禍，在強烈的罪惡感煎熬下，小樹必須冒死救出阿袋，展開二度逃亡。
小樹力抗鐵甲垃圾車，隻身救出阿袋，終於逃離廢棄城，逃到了臺北市，並且護送阿袋到達族人傳說中的回收場，離別的時刻真正來臨，小樹看著阿袋與眾廢棄物走進回收場，找到再生的機會，踏上人生新的旅程，小樹也開始捫心自問自己的回收場在哪裡？自己再生的機會在哪裡？小樹期待未來如果重逢，他們都已經擁有嶄新的人生…

此去经年，窟卢塔族惨遭灭族的伤痛依然时时折磨着最后的遗民酷拉皮卡（泽城美雪 配音）的身心。在追寻幻影旅团的旅途中，酷拉皮卡竟意外重逢当年的本族好友Bairo，谁知却被对方夺去了号称“七大美色”之一的绯红之眼。他的遭遇经雷欧力之口，很快传到了奇犽（伊濑茉莉也 配音）和小杰（潘惠美 配音）的耳中。为了找到伤害朋友的真正凶手，他们四处追查对方的藏身之地，在这一过程中结识了美丽神秘的少女小列，同时遭到一群死亡人偶的攻击。另一方面，西索（浪川大辅 配音）突然现身酷拉皮卡和雷欧力面前，向他们揭示了凶手的真实身份。盘根错节的恩怨，拉开了一场惨烈战斗的序幕……
　　本片根据漫画家富樫义博的同名原作改编，为该动画的首部剧场版。

庆应三年——幕末动乱时代。
　　由于将军德川庆喜的大政奉还，江户幕府濒临解体，幕府与讨幕派的对立日渐激化。近藤勇、土方岁三率领的新撰组，在经历油小路事件后遭受重创，即使如此仍然决定向庆喜效忠。
　　此时，皇帝向萨摩藩、长州藩下达了讨幕的密敕，并紧接着颁布了王政复古的大号令。朝廷宣告了德川幕府的终结。对此承诺的庆喜移居大阪，新撰组也再一次以并非“浪士集团”而是“幕臣”的身份备战，将屯所移至伏见奉行所。
　　新撰组队士·市村铁之助，怀着对从以前开始就关系亲密的少女·沙夜的思念，以副长·土方岁三小姓的身份，与身为队医的好友山崎烝、兄长辰之助一起，准备共同迎来身为新撰组一员的命运，但……。
　　期盼成为武士而前往京都的年轻人们，为了能够衣锦还乡而向着战斗突进。即使最终迎来的会是悲伤的别离……。

根据古典小说记载，世上有人有妖，妖会与人相恋，妖寿命千万年，人的寿命有限，人死了，妖活着。人会投胎转世，但投胎以后，不记得上辈子的爱。妖如果痴情的话，就去找狐妖“购买”一项服务，让投胎转世的人，回忆起前世的爱。