一天毛利小五郎收到一张请帖,里面是谜样男子的委托,需要前往横滨的一个游乐场。小五郎和柯南一行人快乐地到达欢乐的游乐场,还带上了可以出入无阻代表VIP的手表,不料正中那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场,否则便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点,柯南和小五郎如果不能解开谜题,兰和少年侦探团也会随着游乐园粉身碎骨。然而更意想不到的是,那名男子居然直接称呼柯南为工藤新一。
此去经年,窟卢塔族惨遭灭族的伤痛依然时时折磨着最后的遗民酷拉皮卡(泽城美雪 配音)的身心。在追寻幻影旅团的旅途中,酷拉皮卡竟意外重逢当年的本族好友Bairo,谁知却被对方夺去了号称“七大美色”之一的绯红之眼。他的遭遇经雷欧力之口,很快传到了奇犽(伊濑茉莉也 配音)和小杰(潘惠美 配音)的耳中。为了找到伤害朋友的真正凶手,他们四处追查对方的藏身之地,在这一过程中结识了美丽神秘的少女小列,同时遭到一群死亡人偶的攻击。另一方面,西索(浪川大辅 配音)突然现身酷拉皮卡和雷欧力面前,向他们揭示了凶手的真实身份。盘根错节的恩怨,拉开了一场惨烈战斗的序幕…… 本片根据漫画家富樫义博的同名原作改编,为该动画的首部剧场版。