萌学园，传说成立的时间是在地球诞生的年代，是一所由夸克族人组成的魔法学校，隐藏在地球大气层外平行空间里，并由现任萌骑士幻之星（李昂霖 饰）、炎之星（刘书宏 饰）、智之星（林奕勋 饰）、十之星（阿本 饰）、月之星（彩虹 饰），代代相传，守护地球的和平。在一次抢救魔法生物的任务中，意外引来宇宙中的黑色力量莫尔斯（傅冠杰 饰），威胁萌骑士交出磐古，召唤出萌学园的过去，否则将用魔法抽干地球水资源，让所有生命干涸而死！磐古，究竟是什么？为了拯救地球，萌骑士踏上寻找磐古的旅程，竟发现磐古的神秘力量与自己的魔法有着密不可分的连接结，然而要付出什么代价才能阻止莫尔斯夺走磐古？与萌骑士一起面对跟地球共存亡的关键战役！
东南亚某无人荒岛，一支由志愿者和机器人组成的救援队进行演练时，遭遇脾性古怪的奇兽追击，不断有巨兽冲击营地。逃亡过程中，救援队意外发现了“野人”袁元忠，这才得知岛上的变异怪相源于一年前基地的核废料泄露事故。为避免更大的危机，众人决定处理遗留的放射物质。危险的基地再次被打开，狰狞巨鳄倾巢而出，疯狂撕咬志愿者，獠牙阴森的兽人和变异巨兽将他们层层围堵。救援队联手机甲与群兽拼死打斗，争斗间丛林深处又传来阵阵嘶吼声，更多巨兽蜂拥而至……
