初入职场的秦明（张耀 饰）为了调查母亲遇害的谜团时意外被卷入一宗凶杀案，因此结识了安然（汤敏 饰）、林涛（彭楚粤 饰）、环环（马昕墨 饰）等一众法医和警员。剧中每一个案件背后都是一个社会话题，每一个案件独立却又与一个巨大阴谋有着千丝万缕的联系。剧集根据《法医秦明》系列的第一部作品改编。
故事发生在东晋末年，失传已久的青鸾镜和离殇剑重出江湖，传闻中同时拥有两物者，便能获得称霸天下的强大力量。龙教圣女紫魅（ 田丽 饰）是唯一知道两物下落的所在，然而她因练功而走火入魔，命不久矣。临死之前，紫魅将青鸾镜和离殇剑的秘密告诉了龙教传人元清锁（张含韵 饰），希望元清锁能够寻得两物，将它们交付于忠贞正直之士。就这样，元清锁隐姓埋名，假冒司空夫人的外甥女李娥姿，踏上了寻找宝物的旅途，一路上，元清锁结识了兰陵王高长恭（陈奕 饰）和北周大司空宇文邕（彭冠英 饰），随着时间的推移，三人陷入了一段纠葛离奇的恋情之中。
