维拉特,是名军人,但同时也是国防情报局的特工.在一年一度的兵士回家度假中,遭遇了恐怖袭击,亲眼目睹了一公交车的孩子和学生被炸死.在擒获恐怖分子(休眠者)分析了所得资料后,他安排了一个计划,这个计划,连他妹妹都搭进去了.然而,在他以为他抓获了休眠者的头头,她妹妹的一番话让他顿感一盆冷水泼在头上.......
故事发生在南诏王阁罗凤重病，其孙异牟寻准备登基为王时期，阁罗凤之子凤伽异早逝，其子异牟寻聪慧能干，善于抚慰百姓，但因异牟寻年纪尚轻，内有众多大臣不愿归顺于他。只有阁罗凤之前俘虏的郑回一直感恩阁罗凤不杀之恩还予以重用，对异牟寻也处处关心照顾。阁罗凤临死前立南诏德化碑，表明叛唐出于不得已，愿与唐世代友好，异牟寻也早有此意，但是南诏当时还有很多大臣反对归顺大唐，两种主张、两派势力早已明争暗斗，故事就是在这样的背景下诞生的，势单力薄的南诏想归顺大唐，将归顺之意秘密送达并得到大唐的支持，一路上凶多吉少，杀机四伏······
1979年，昆仑山发生神秘生物骸骨，由胡八一（赵又廷 饰）率领的探险队深入昆仑山腹地，寻找有关古生物遗迹的更多秘密，却不料在这个过程中遭到不同神秘生物的轮番攻击，并意外坠入九层妖塔，除胡八一外，一行人生死成谜。 胡八一退伍后回到北京，重逢了发小王凯旋（冯粒 饰），并在神秘人（李晨 饰）与科考队（凤小岳、唐嫣、李光洁 饰）两股力量的夹缝中重新踏上了探寻未知文明的征程，途中与Shirley杨（姚晨 饰）邂逅，熟识的面孔唤醒了他身处探险队那段日子的记忆。此行凶险，在还没来得及搞清楚Shirley的真实身份之际，胡八一、Shirley、王胖子率领一行人便在王子墓、石油小镇等地遭到不明生物的轰炸，这里所发生的一切再度指向九层妖塔，而这次等待他们的，将是一个尘封已千年的未解之谜……
阿杰（张学友 饰）是位飞虎队里的精英，他与父亲肥波（吴孟达 饰）的关系并不好。肥波当年做警察的时候得罪了重案组的探长洪坤（秦沛 饰）受到报复，以致生活艰苦。竟在一次与流氓打架时错手打死了大儿子。阿杰也因为如此始终难以原谅父亲。此时的肥波已经退休，在夜总会上班，有个做舞女的女友阿红（吴家丽 饰）。 阿杰营救了被劫匪挟持的Heidi（郑秀文 饰），两人互生好感。冤家路窄的是，Heidi竟然是洪坤的女儿。洪坤也没有再当警察，而是当上了黑帮头目。他知道自己的女儿喜欢上了阿杰，心狠手辣的他决意拆散他们，更找人追杀阿杰。 肥波为了保护儿子被烧死了，阿杰誓要找洪坤算账，但是又遭到了Heidi出面阻止……
